مطالعه فیلوژنتیکی و ساختاری پلی‌آمین اکسیدازهای گیاهی
نویسندگان
چکیده مقاله:
محتوای پلی‌آمین‌های درون سلولی نه تنها توسط بیوسنتز و انتقال بلکه توسط کاتابولیسم آن‌ها به وسیله پلی‌آمین اکسیدازهای (PAO) وابسته به فلاوین آدنین دی‌نوکلئوتید (FAD) تنظیم میشود. نتایج حاصل از مطالعات مختلف در مورد پروتئین‌‌های PAO در فرایندهای مختلف نموی و پاسخ به تنش‌های محیطی تأیید کننده اهمیت این پروتئین در زندگی گیاهی می‌باشد، با این حال مطالعه جامعی در مورد روابط فیلوژنتیکی و ساختاری PAOs گیاهی وجود ندارد. در این مطالعه آنالیزهای بیوانفورماتیکی به منظور درک بهتر روابط فیلوژنتیکی و ساختاری بر روی 58 توالی پروتئینی PAO از 15 گونه مختلف گیاهی انجام شد. کلاسترهای چندگانه با دو برابر شدگی ژنی هم در گونه‌های تک‌لپه‌ای و هم در گونه‌های دو لپه‌ای شناسایی شد. بر اساس موتیف‌های حفاظت شده به‌دست آمده توسط ابزارهای MEME و MAST، چهار موتیف در بیشتر گونه‌های گیاهی یکسان بودند. آنالیزهای ساختاری بر روی PAOs مربوط به Oryza sativa و Arabidopsis thaliana به عنوان نماینده گیاهان تک‌لپه‌ای و دو لپه‌ای که اطلاعات ساختاری آن‌ها در دسترس نبود، انجام شد. آنالیز ساختار دوم نشان داد که مارپیچ آلفا در میان عناصر ساختار دوم غالب بوده و پس از آن به‌ترتیب راندوم کویل، صفحات بتا و دور بتا برای تمامی توالی‌ها دارای بیشترین مقدار بود. پیش‌بینی ساختار سوم توسط سرور SWISS-MODEL انجام شد. ساختمان این توالی‌ها دارای دو دومین مشترک بود. این اولین مطالعه در مورد روابط فیلوژنتیکی و ساختاری PAOs گیاهی است و این نتایج ممکن است مبنای نظری برای مطالعات آتی در مورد جزئیات ساختمانی و عملکردی PAOs گیاهی فراهم کند.
منابع مشابه
مطالعه فیلوژنتیکی و فیزیکوشیمیایی ژن SOS1 در گونه های مختلف گیاهی
سابقه و هدف: سیستم های SOS مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می‌کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه Tair، EBI، NCBI، plantcare وEXPASY و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افز...
متن کاملمطالعه فیلوژنتیکی و فیزیکوشیمیایی ژن sos۱ در گونه های مختلف گیاهی
سابقه و هدف: سیستم های sos مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه tair، ebi، ncbi، plantcare وexpasy و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افزار...
متن کاملمطالعه بیوسیستماتیکی و فیلوژنتیکی گونهtanacetum fisherae
گونه tanacetum fisherae به عنوان رکورد جدیدی برای فلور ایران از استان کرمان گزارش می شود. عدد کروموزومی (2n=5x=44+1b) و همچنین سطح پلوییدی پنتاپلوییدی برای جنس tanacetum برای نخستین بار ارایه می گردد. نقشه پراکندگی این گونه در دنیا و ایران، شرح کامل و صفات ریزریخت شناسی میوه ارایه شده است. یک نتیجه گیری تاکسونومیکی براساس داده های مولکولی (nrdna its) و مورفولوژیکی برای روشن شدن جایگاه تاکسونومی...
متن کاملمطالعه فیلوژنتیکی سویه‌های یوروپاتوژنیک اشریشیاکلای در منطقه سیستان
Background and Aim: Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains are a causative agent in most of the urinary tract infections (UTIs), which constitute a multitude of virulence factors. There is little information about phylogenetic group distribution, types, and their virulence factors in Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) in different areas of Iran. In the present study, the phylogenic pa...
متن کاملتأتیر معدن بوکسیت بر پارامترهای ساختاری پوشش گیاهی مراتع (مطالعه موردی: مراتع صدر آباد ندوشن یزد)
آلودگیهای محیط زیست مانند معدنکاوی یکی از مهمترین نگرانیهای مسؤلین در همه کشورها محسوب میشود که نقش مهمی در به هم خوردن تعادل اکوسیستم ها دارد. بنابراین مطالعه اثر این آلودگیها بر اکوسیستم های مرتعی از اهمیت زیادی برخوردار است. به منظور اندازه گیری ویژگیهای پوشش گیاهی با توجه به فرم رویشی غالب و همگنی پوشش گیاهی، نمونه برداری بطور سیستماتیک تصادفی با استفاده از ترانسکت 50 متری و پلات 2 م...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 9 شماره 26
صفحات 19- 36
تاریخ انتشار 2019-07-23
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023